2006年党委书记为张秉义，校长关爱和。

2006年，学校毕业学生7894人，其中研究生668人，全日制本科生5056人，成教生2170人。招收新生14749人，其中博土研究生46人，硕土研究生1317人，全日制本科生8107人，成人教育学生5279人。截至年底，学校设有26个学院和4个公共教学部，有72个本科专业，拥有1个博士一级学科和16个博士点，24个硕士一级学科和175个硕士点，3个博士后流动站。全校在岗教职工3955人（不含附属医院），其中院士10人，各类在校生50466人，其中博士生128人，硕士研究生3624人，普通本科生30406人，留学生149人，成人教育学生16159人。

1月，学校隆重举行人文社会科学学科建设专家指导委员会成立仪式。来自中国社会科学院研究生院的张宇燕等6为知名专家及耿明斋等8位校内专家受聘为首批委员。当月，教育部公布了第10批博士和硕士学位授权学科、专业名单。河南大学地理学获得一级学科博士学位授予权，实现了学校一级学科博士学位点零的突破；政治经济学等7个专业获得博士学位授予权；哲学等21个一级学科89个专业获得硕士学位授予权。

2月，学校召开学科与学位点建设工作会议。根据学校部署，此后两年内，学校计划投入3000余万勇于学校学科与学位点建设，并将首次以学科建设目标责任书的形式推进学科与学位点的建设与发展。当月，赵国祥、李小建、秦耀辰、赵瑾、张倩红、陈志国、汪基德等7位教授被聘为教育部相关学科教学指导委员会委员。

3月，CUBA大学生篮球联赛西北赛区比赛开幕式在体育馆举行。开幕式结束后，河南大学男篮与山西财经大学男篮展开激烈竞争，最终以77:66获胜。中央电视台第五套节目对开幕式进行了现场直播。后战胜中国民用航空学院对，率先闯入了CUBA全国四强，实现了历史性突破。

4月，河南大学举行马克思主义研究院揭牌仪式，中共中央编译局原常务副局长顾锦屏等出席了揭牌仪式，顾锦屏与河南省教育厅副厅长李文成共同为马克思主义研究院揭牌。

6月，河南大学近代建筑群获批为第六批全国重点文物保护单位。河南大学近代建筑群作为近现代重要史迹及代表性建筑项，序号为984，编号为V—111，单位名称为“河南留学欧美预备学校旧址”，时代为“民国”。

2006年6月13日，大洋洲、澳洲中国和平统一促进会名誉顾问、北京两航起义人员联谊会会长、著名校友刘敬宜之子刘道仲先生来校访问。

9月，省委书记、省人大常委会主任徐光春莅临学校，代表省委、省政府对全校教职工生表达节日问候。徐光春实地考察了明伦校区，听取校领导张秉义、关爱和的汇报，高度评价了学校半年办学历史，表示省委、省政府将继续关注、支持河南大学的发展，创造更好的条件，给予更大的支持，促进河南大学重振百年名校的风采。

2006年9月6日，省委书记徐光春视察河南大学并发表重要讲话。

10月，河南大学召开全校科研大会，教育部社会科学司副司长袁振国，广东省科技厅副厅长雷朝滋，国家自然科学基金委计划局副局长孟宪平，中国工程院院士薛群基、山仑，中国科学院院士王占国、干福熹等出席会议。会议对“十五”期间未学校科研工作作出突出贡献的集体和个人进行了表彰。当月，河南大学承办的“追赶长征”河南省高校纪念长征胜利70周年大型歌舞晚会在河南省体育馆上演。徐光春、孔玉芳、祁正祥、夏清成、王菊梅等省领导观看了演出。

2006年10月21日，学校独立承办的“追赶长征”歌舞晚会在郑州上演。

12月，环境与规划学院院长秦耀辰等代表学校“郑开大道及两侧功能区规划景观模拟系统”项目组参加省长办公会，向省领导展示项目成果。省领导对其给予高度评价，希望学校进一步完善，在更高层次上成为未来15年郑开大道两侧功能区规划的技术平台，引领郑开大道两侧功能区的规划与管理工作。