1944年校长为王广庆（10月止）、张仲鲁（10月始）。

1944年5月，日寇进犯潭头，制造“潭头惨案”，河大9位师生与眷属遇难。学校先后流亡到淅川荆紫关和陕西汉中办学。当年毕业本科生192人，招收新生300余人。截至年底，学校设4个学院9个系，在校生1110余人，教职员257人。

 

1944年4月，“患难见真情”，国难之中将要分手的同学们一起留影

 

5月10日，日军进犯嵩县，医学院300余名师生撤出县城奔向潭头。12日，河大师生撤离潭头，分别到几十里外的大青沟和重渡沟集合。15日，日军进入潭头，羁留镇中的部分师生和家属被迫向北山转移，途中遭袭，6人不幸饮弹身亡，20余人被俘。16日，日军血洗潭头，河大学生刘祖望、李先识、李先觉等不幸遇难。

 

1944年4月9日，国立河南大学诸友欢送海瑞、锡庆、乐图毕业留念。

 

6月，河南大学师生经长途跋涉陆续到达位于豫鄂陕3省交界之处的淅川县荆紫关。

7月，校长王广庆向教育部呈文，详细报告了河南大学在潭头沦陷后逃亡过程和人员与财物损失情况，后向教育部部长陈立夫提交辞呈，申请引咎辞去校长职务。

 

1944年5月15日，日寇制造“潭头惨案。图中，左为在潭头遇难的吴鹏同学，中为化学系刘祖望同学，右为不甘受辱，投井身亡的医学院李先识同学。

 

9月，河南旅川同乡会致信教育部部长陈立夫，希望指定地点收容流亡重庆及陕甘的河南学生，拨付专款予以教济；指定西北一所大学暂借河南大学使用，以期早日复课等。国立河南大学重庆校友会致电王广庆校长，建议速选省内合适校址复课，或与西北高校联合办学；希望学校宏谋掌划，迅筹措施，使学校早纳正轨，辉煌旧业。同时致电河南大学同学会，希望全体学生体念时艰，光我校爱护之忧，共申同舟之义，协助校方勘定校址，早谋复课。

 

9月，学校借用荆紫关一所小学稍加扩建，于暑假后正式复课。医学院院长张静吾等6人致信教育部，陈述医学院特殊困难，要求拨付专款给医学院，以便早日复课。医学院则因图书仪器短缺，经学校同意继续西上，到陕西汉中复课。

 

10月，行政院院长蒋中正签发训令，称“国立河南大学校长王广庆呈请辞职应予免职，遗缺任命张广舆（仲鲁）继任”，令教育部知会张广舆先行代理，后依法任命。张广舆（仲鲁）先生接任国立河南大学校长后，四处奔波、募得款项400万元和大批医药用品，使学校教学科研工作得以恢复。

 

12月，教育部督察沈亦珍上报视察河南大学情况，称学校到达荆紫关后，仪器设备损失严重，师生生活异常艰苦，但教务、训导、总务等工作均尚认真，教育部有必要予以抚恤救济。